Banyak masjid yang terbangun tetapi masjid di komplek Pondok Pesantren adalah fasilitas penting tak ubahnya nadi dalam sendi kehidupan santri. Berdirinya masjid untuk melaksanakan fungsinya yang sangat krusial ini selalu diupayakan agar aktifitas ibadah santri lebih berkualitas. Masjid Daroin dalam hal ini bukan hanya difungsikan sebagai sarana ibadah santri, tapi juga tempat berlangsungnya kajian ilmu, dakwah, kegiatan keagamaan, peringatan hari-hari besar dan lain sebagainya.